退運貨物的處理相對來講比較繁瑣，需要根據貨物的不同情況來選擇具體的退運方式。

第一種方式：一般貿易進口

如果貨物出口時按照正常的報關報檢程序出口，則一般進口時可以按照一般貿易進口的方式進來。具體又分為以下三種情況：

情況一、已辦理退稅，退關退貨的處理。

出口企業出口貨物發生退關退貨后，出口企業必須向所在地主管出口退稅的稅務機關辦理申報手續，補繳已退（免）的稅款，如果退運的貨物已經申報辦理退稅的，并分別依以下情況予以處理：
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（一）如出口企業將退關退運貨物加工整理，更換相同規格型號的貨物重新出口，或將退運貨物退給供貨企業不再出口的，出口企業應持有關憑證到其主管退稅的稅務機關申請辦理“出口商品退運已補稅證明”及“進貨退出及索取折讓證明單”（以下簡稱“證明單”），出口企業或供貨企業憑證明單沖減當期銷售收入和銷項稅額。

（二）出口企業將退關退運的貨物轉為內銷的，應持有關憑證到其主管退稅稅務機關辦理“出口轉內銷證明單”，作為其內銷時進項抵扣憑證。

情況二、已申報、未辦理退稅、退關退貨的處理

出口企業將購進貨物的增值稅專用（抵扣聯）報送給主管出口退稅稅務機關后，貨物發生退貨而轉作內銷或部分內銷的，企業須向主管出口退稅的稅務機關申請辦理“出口商品退運已補稅證明”，其應退稅款在退稅總額中予以扣除或比照已退稅業務補交稅款（已申報資料正常辦理退稅）。同時，外貿出口企業還應填列“出口貨物轉內銷證明”，經主管出口退稅稅務機關簽章后，作為內銷時抵扣進項稅額的憑證，企業申報的增值稅專用（稅款抵扣聯）留存退稅機關。

情況三、未申報退稅，退關退貨的處理

對出口企業尚未申報退稅卻已發生退關退貨并轉作內銷的，由于有關原始單據在企業，由出口企業提出書面申請并提供有關原始單據，經主管稅務機關審核后，在書面申請報告及原始單據上簽注“未辦理

第二種方式：快遞進口

如果貨物出口時是通過買單或者委托其他進出口公司出口，退運時通常可以考慮快遞進口的方式。這樣手續簡單，而且時間上比較短，一般當天上午申報，下午即可放行到貨。

第三種方式：貨入保稅區加工復出口

由于保稅區有境內關外的政策，從國外退運的貨物退到保稅區還等于貨物留在國外，還沒有進入國內海關所管轄的范圍無需向海關申請退運貨物.此種處理方式的優點是：

1、無須辦理復雜的退運手續，無需向海關申請退運貨物無需交納保證金無須報進口關。
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2、復雜問題簡單化，節約時間、成本.特別從香港碼頭提貨到福田保稅區(帶辦理手續時間)只需三個小時國內廠家可以自帶工人到區內維修，成本是在香港維修費用三分一。