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廣州貫善生物科技有限公司

主營:高通量測序,蛋白質組學,分子生物學
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[供應]miRNA測序
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  • 產品產地:廣東廣州
  • 產品品牌:貫善生物
  • 包裝規格:SATXAM2016
  • 產品數量:1000000
  • 計量單位:個
  • 產品單價:3500
  • 更新日期:2016-06-13 08:49:39
  • 有效期至:2017-06-13
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miRNA測序 詳細信息

miRNA測序服務

 

    小RNA是一類內源性的具有調控功能的非編碼RNA,主要包括miRNA、piRNA和siRNA等;它的功能主要是誘導基因沉默,參與基因轉錄后調控,在發育、病毒防御、造血過程、器官形成、細抱增殖和凋亡等環節起著重要調控作用。

    小RNA測序目標:

        1. miRNA長度,莖環結構,miRNA前體加工,靶基因結合位點和預測;

        2. 轉錄組和小RNA數據的聯合分析。

 

    一、技術流程

 

 

    二、生物信息學分析內容

        1. 測序質量分析與統計、評估;

        2. microRNA,rRNA,tRNA,intron,exon,snRNA,snoRNA注釋;

        3. microRNA的表達量差異分析;

        4. microRNA表達模式聚類分析;

        5. microRNA保守性分析;

        6. microRNA與靶基因之間的調控, microRNA靶基因之間的蛋白-蛋白相互作用網絡分析;

        7. 靶基因預測;

        8. 新miRNA預測。

 

    三、結果展示

        1. 數據庫使用

數據庫

網頁鏈接

miRBase

 

Rfam

   

        2. 版圖展示

 

        圖1.1所示,反映樣品間相似性,以及各miRNA的表達模式相似性;

圖1.1 差異基因聚類熱圖

 

        圖1.2所示,預測miRNA;

圖1.2 miRNA預測

 

    四、樣本要求

        總量:〉4 μg RNA;濃度:〉50 ng/μL

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