貫通式貨架的設計原理是把數排傳統式貨架連接起來，貫通式貨架沒有專用的走道，貫通式貨架其配置方式可以為兩組駛入式貨架背對背安裝或單一組靠墻，叉車的進出皆使用相同的走道。存放時先由內部存放，再依序向外存放，而出貨時先由外部貨物取出，再向內依序取貨，儲存密度非常好，但不能先進先出。
適合周期性批量作業及存取物料頻率高的原料倉庫或轉運倉庫。
貫通式貨架：適合存儲大批量、品種少的貨物，叉車可直接進入貨道內存儲貨物，倉庫利用率高。