非金屬補償器的缺點是安裝蒙皮時會泛起一個凹槽，這個凹槽在機組運行時積蓄了大量的酸水，酸水會通過膨脹節織物慢慢滲透滲出到固定膨脹節蒙皮的壓板螺絲上，造成螺絲松動和侵蝕斷裂，或織物層破壞，所有的酸水就會從斷裂的螺絲孔和蒙皮破損處流出，嚴峻的會泛起小瀑布現象，造成損壞地面和環境污染，嗆人的酸味給環境造成極大的破壞。
從運行情況來看，一般一到兩年就會泛起侵蝕和破損；大多廠家都采取了一些措施，好比中央開洞加一條引流管，但仍舊阻止不了蒙皮的侵蝕穿透，反而因為溫度的變化造成引流管錯位而拉壞蒙皮，形成新的泄漏點，因此無法從根本上解決這個題目。
另外，因為非金屬補償器為多層蒙皮設計，運行時各層間會泛起積水現象，也是新換了膨脹節蒙皮還會滲水的主要原因。