全自動自清洗過濾器只有正確的安裝，才能使砂石過濾功能發揮出應有的效能，應先確認第一次運行水體透過濾料時的水頭損失值。若安裝不正確，可能使水頭損失達7—17m，遠遠超過允許的2—3.5m。安裝時應遵循以下步驟:
① 全自動自清洗過濾器先向過濾罐中裝入花崗巖礫，再裝中粗粒的砂介質，最后裝入最細的砂介質。若花崗巖礫及濾料在運輸中受到污染，必須用水洗凈后才能裝入過濾罐中。
② 全自動自清洗過濾器嚴格按照廠商給出的各介質層厚填裝相應的濾料。
③ 關閉全自動自清洗過濾器上的反沖控制閥，關小排污管上的流量調節閥，打開干管上的主閥，然后啟動機組。
④ 緩慢打開全自動自清洗過濾器的反沖控制閥，然后緩慢增大流量調節閥的開度，但確認反沖流量在允許范圍內（后面還將詳細闡述反沖流量的調節方法）。這樣做是為了保證水體緩慢透過濾料，但又不把細粒濾料帶到罐底部而堵塞集水裝置。
⑤ 全自動自清洗過濾器關閉該罐的反沖控制閥，對其它所有過濾罐重復④的動作。
⑥ 按全自動自清洗過濾器④、⑤的方法再對每個罐沖洗一遍后，關閉所有反沖控制閥，使過濾系統進入正常供水狀態。
一個合理的砂石過濾系統，還應具備以下條件:
① 全自動自清洗過濾器砂石過濾系統的過濾容量應比灌溉系統所要求的容量大。
② 全自動自清洗過濾器砂石過濾系統的總過水量應與所采用的灌水器流量相適配。
③ 應合理布置砂石過濾系統的排污管，以利于沖洗過濾罐和雜質排出。
④ 應在泵入口處安裝初級全自動自清洗過濾器，先處理掉水體中漂浮的大顆粒雜質。
⑤ 與砂石過濾器配套，應在首部安裝流量計、水表和壓力表，這些設備不僅用于監測砂石過濾系統的效能，而且可用來觀測整個微灌系統的運行狀態。
⑥ 全自動自清洗過濾器應在施肥器入口的下游裝有網式或疊片式過濾器，以攔截施肥中不溶于水的雜質；同時若砂石過濾器出現故障或誤操作，可防止雜質進入微灌系統，不致于造成整個微灌系統癱瘓。
為了避免水質突變和人為誤操作引起的一系列問題，砂石過濾系統常采用自動反沖洗。自動反沖洗砂石過濾系統的主要問題是，如何保證反沖的壓力和沖洗時間。
① 全自動自清洗過濾器用壓差計測量過濾系統進、出口的壓差值，當此值達到預設的壓差時，產生一個電信號并反饋給控制器，控制器即依次自動打開每個罐上的反沖控制閥，從而實現自動反沖洗；同時控制器中裝有一個計時器，可預設沖洗延續時間。在潔凈的濾料既定的水頭損失上再加3.5—5.0m即為要預設的壓差值，此值一般界定在5.5—10m之間，關鍵取決于濾料潔凈狀態下既定的水頭損失大小，因此首先要確認濾料潔凈狀態下既定的水頭損失值。為了防止罐底部集水裝置被細小的濾料堵塞，預設壓差不宜過大，適度增加反沖洗頻率。
② 從一個罐反沖控制閥關閉到另一個反沖控制閥完全打開之前，必須預留一定的延時，以便壓力回升使每個罐均能獲得相同的足夠的反沖壓力。
③ 全自動自清洗過濾器定期檢測排污管排出的水質是否潔凈，若發現反沖過程末排出的水中仍含有雜質，說明罐中雜質未被反沖干凈，應適當調長反沖延續時間。
全自動自清洗過濾器是除去液體中少量固體顆粒的小型設備，可保護壓縮機、泵、儀表和其它設備的正常工作，當流體進入置有一定規格濾網的濾筒后，其雜質被阻擋，而清潔的濾液則由過濾器出口排出，當需要清洗時，只要將可拆卸的濾筒取出，處理后重新裝入即可，因此，使用維護極為方便。

1、對于易燃、易爆、有毒的介質，以及小口徑全自動自清洗過濾器可選用承插焊連接、對焊連接的過濾器，經常需要檢修更換的宜選用法蘭連接的過濾器。
2、全自動自清洗過濾器的本體材料應與相應的管道材料一致或相當，濾網無特殊要求時，均為不銹鋼絲網。
3、對固體雜質含量較多的、粘度較大的工作介質，選過濾面積較大的籃式過濾器為宜。
4、全自動自清洗過濾器濾網目數的選擇應考慮能滿足工藝過程的需要或對泵、壓縮機等流體輸送機械起到保護作用的目的。